26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5328 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5328  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0470  hypothetical protein  85.05 
 
 		 107 aa  172  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5053  hypothetical protein  84.11 
 
 		 107 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0363  hypothetical protein  91.59 
 
 		 108 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5152  hypothetical protein  88.79 
 
 		 108 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.456332  normal  0.766946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4975  hypothetical protein  88.79 
 
 		 108 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5102  hypothetical protein  88.79 
 
 		 108 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05030  hypothetical protein  55.66 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0484  hypothetical protein  55.66 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4164  hypothetical protein  50.47 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0514  hypothetical protein  35.51 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.95823e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1777  hypothetical protein  28.3 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297893  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0054  hypothetical protein  28.97 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3038  hypothetical protein  30.39 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3959  hypothetical protein  28.57 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0784  hypothetical protein  30.49 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145033 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3723  hypothetical protein  26.42 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3906  hypothetical protein  26.42 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3780  hypothetical protein  26.42 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0545  hypothetical protein  26.42 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0808  hypothetical protein  28.41 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3553  hypothetical protein  21.7 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3293  hypothetical protein  27.91 
 
 		 111 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0584  hypothetical protein  26.74 
 
 		 111 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3445  hypothetical protein  26.74 
 
 		 111 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0585  hypothetical protein  26.74 
 
 		 111 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.182991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>