26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5102 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4975  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5102  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5152  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.456332  normal  0.766946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0363  hypothetical protein  96.3 
 
 		 108 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5328  hypothetical protein  88.79 
 
 		 107 aa  167  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0470  hypothetical protein  80.37 
 
 		 107 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5053  hypothetical protein  79.44 
 
 		 107 aa  164  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0484  hypothetical protein  54.72 
 
 		 107 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05030  hypothetical protein  54.72 
 
 		 107 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4164  hypothetical protein  50.47 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0514  hypothetical protein  34.26 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.95823e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1777  hypothetical protein  26.42 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297893  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0054  hypothetical protein  26.85 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0808  hypothetical protein  30.68 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3038  hypothetical protein  28.43 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3553  hypothetical protein  23.58 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3906  hypothetical protein  25.93 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3780  hypothetical protein  25.93 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3723  hypothetical protein  25.93 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0545  hypothetical protein  25.93 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3959  hypothetical protein  27.62 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0784  hypothetical protein  26.83 
 
 		 114 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3216  hypothetical protein  26.85 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000833227  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0584  hypothetical protein  26.14 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3445  hypothetical protein  26.14 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0585  hypothetical protein  26.14 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.182991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>