32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3954 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3954  mutator MutT protein  100 
 
 
124 aa  248  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  67.16 
 
 
212 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  50 
 
 
210 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
205 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
194 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
205 aa  53.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  33 
 
 
205 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  33 
 
 
205 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  40 
 
 
205 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  46.81 
 
 
205 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  46.81 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  46.81 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  40 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  34.33 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  34.33 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 
215 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
209 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
218 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  37.93 
 
 
229 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1205  NUDIX family hydrolase  28.57 
 
 
204 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00320321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0773  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195628  hitchhiker  0.00363366 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
209 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
153 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  34.48 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  34.48 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  34.48 
 
 
153 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  34.48 
 
 
153 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  34.48 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  34.48 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>