16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2550 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2550  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  387  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03040  hypothetical protein  34.32 
 
 
194 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4794  hypothetical protein  33.53 
 
 
202 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1331  hypothetical protein  30.95 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4901  hypothetical protein  32.09 
 
 
198 aa  95.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3874  hypothetical protein  27.37 
 
 
188 aa  91.3  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.912957  normal  0.123813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3116  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  89  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0221368  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3220  hypothetical protein  29.38 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1491  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00278344  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2817  hypothetical protein  22.92 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.508332  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0851  hypothetical protein  32.54 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00740746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1905  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1574  hypothetical protein  31.76 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60477  hitchhiker  0.00480214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3225  hypothetical protein  30.23 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13040  hypothetical protein  29.94 
 
 
255 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3208  hypothetical protein  30.95 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.642161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>