25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0437 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  97.16 
 
 		 459 aa  742    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  882    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  76.72 
 
 		 454 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  75.77 
 
 		 454 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  75.77 
 
 		 456 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  72.51 
 
 		 462 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  76.91 
 
 		 447 aa  602  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  75.33 
 
 		 454 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  76.96 
 
 		 461 aa  591  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  75.33 
 
 		 455 aa  578  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  73.71 
 
 		 462 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  66.82 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  62.53 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  39.95 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  48.03 
 
 		 473 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  38.97 
 
 		 454 aa  296  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  43.1 
 
 		 524 aa  279  6e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  42.27 
 
 		 538 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  42.86 
 
 		 520 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  29.2 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  28.57 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  35.39 
 
 		 508 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  25.54 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  26.42 
 
 		 468 aa  69.7  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1439  hypothetical protein  34.78 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>