More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2487 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  100 
 
 		 503 aa  1030    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  89.58 
 
 		 499 aa  921    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  58.57 
 
 		 494 aa  598  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1981  Aldehyde Dehydrogenase  58.18 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.823861  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.94 
 
 		 497 aa  586  1e-166  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1326  elongation factor P (EF-P)  57.56 
 
 		 491 aa  568  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  56.52 
 
 		 492 aa  569  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  55.07 
 
 		 486 aa  562  1.0000000000000001e-159  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1278  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  57.32 
 
 		 492 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000390072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  54.66 
 
 		 495 aa  553  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  54.66 
 
 		 495 aa  553  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2913  aldehyde dehydrogenase  52.85 
 
 		 506 aa  537  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.701952  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4152  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  52.04 
 
 		 509 aa  521  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2370  Aldehyde Dehydrogenase  52.03 
 
 		 500 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0344  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 541 aa  519  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1008  aldehyde dehydrogenase  52.86 
 
 		 506 aa  521  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1742  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  51.83 
 
 		 506 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17535  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5650  aldehyde dehydrogenase  52.45 
 
 		 507 aa  519  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260352  hitchhiker  0.00474068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3281  aldehyde dehydrogenase  52.76 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2131  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  52.65 
 
 		 506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.183507  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2872  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  52.45 
 
 		 506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1790  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  52.65 
 
 		 506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.308422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1414  aldehyde dehydrogenase  50.61 
 
 		 506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2084  aldehyde dehydrogenase  50.72 
 
 		 497 aa  513  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4570  aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 		 506 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2339  aldehyde dehydrogenase  51.84 
 
 		 506 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3574  aldehyde dehydrogenase  50.88 
 
 		 506 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0149  aldehyde dehydrogenase  51.22 
 
 		 507 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.1483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2967  aldehyde dehydrogenase  50.82 
 
 		 501 aa  511  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.339954  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3942  aldehyde dehydrogenase  50.91 
 
 		 506 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0269  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  50.71 
 
 		 506 aa  510  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00438264 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02420  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  50.61 
 
 		 506 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0599  aldehyde dehydrogenase  50.88 
 
 		 506 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2852  aldehyde dehydrogenase  49.39 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0545  aldehyde dehydrogenase family protein  52.33 
 
 		 506 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2680  aldehyde dehydrogenase family protein  53.16 
 
 		 506 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00858732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1694  Aldehyde Dehydrogenase  49.9 
 
 		 507 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.795203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0597  aldehyde dehydrogenase  52.33 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.04991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0251  aldehyde dehydrogenase  51.12 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0248  aldehyde dehydrogenase  51.12 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3423  aldehyde dehydrogenase  50.82 
 
 		 507 aa  502  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0352428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0364  aldehyde dehydrogenase  50.92 
 
 		 506 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.601797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3083  aldehyde dehydrogenase  53.16 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7559  Aldehyde Dehydrogenase  50.71 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0010  aldehyde dehydrogenase  50.31 
 
 		 506 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0379018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3732  Aldehyde Dehydrogenase  50.82 
 
 		 507 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0305  aldehyde dehydrogenase  50.41 
 
 		 532 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0584  aldehyde dehydrogenase  52.13 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2342  Aldehyde Dehydrogenase  49.8 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.608802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2454  aldehyde dehydrogenase  51.63 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0252  Aldehyde Dehydrogenase  51.32 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000571584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1585  Aldehyde Dehydrogenase  50.31 
 
 		 506 aa  501  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3435  aldehyde dehydrogenase  51.63 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.256643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0248  aldehyde dehydrogenase  51.12 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003330  aldehyde dehydrogenase  49.8 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3123  aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 		 506 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0519809  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1890  aldehyde dehydrogenase  49.9 
 
 		 507 aa  504  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.943834  normal  0.754325 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4480  aldehyde dehydrogenase  50.92 
 
 		 506 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0728  aldehyde dehydrogenase family protein  52.75 
 
 		 506 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1085  acetaldehyde dehydrogenase 2  52.75 
 
 		 506 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0312  Aldehyde Dehydrogenase  51.42 
 
 		 498 aa  498  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4441  aldehyde dehydrogenase  49.8 
 
 		 506 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.896432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3621  aldehyde dehydrogenase  52.14 
 
 		 506 aa  500  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.096261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1874  aldehyde dehydrogenase  51.22 
 
 		 506 aa  500  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.880789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0249  aldehyde dehydrogenase  50.92 
 
 		 506 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3772  aldehyde dehydrogenase  50.92 
 
 		 506 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2726  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 506 aa  501  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0072  Aldehyde Dehydrogenase  50.92 
 
 		 517 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.614712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11810  putative aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 		 506 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.549334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38840  NAD+ dependent acetaldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 		 506 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1366  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  50.82 
 
 		 511 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0250  aldehyde dehydrogenase  50.71 
 
 		 506 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000231621 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0590  aldehyde dehydrogenase  52.13 
 
 		 506 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363947  normal  0.154407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0024  Aldehyde Dehydrogenase  49.9 
 
 		 506 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3616  Aldehyde Dehydrogenase  50.41 
 
 		 507 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0629  aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 		 506 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3310  aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 		 506 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5128  aldehyde dehydrogenase  50.39 
 
 		 506 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3230  aldehyde dehydrogenase  49.39 
 
 		 506 aa  495  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2104  Aldehyde Dehydrogenase  51.43 
 
 		 506 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1399  Aldehyde Dehydrogenase  51.93 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3296  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  50.61 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1192  aldehyde dehydrogenase  48.98 
 
 		 508 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6813  aldehyde dehydrogenase  50.61 
 
 		 506 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160614  normal  0.349252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0058  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  49.8 
 
 		 511 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1964  aldehyde dehydrogenase  51.32 
 
 		 506 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00163057  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3247  aldehyde dehydrogenase family protein  51.02 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2866  aldehyde dehydrogenase  51.12 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2340  aldehyde dehydrogenase  51.22 
 
 		 506 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2498  Aldehyde Dehydrogenase  51.43 
 
 		 506 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3615  aldehyde dehydrogenase  50.61 
 
 		 506 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0115219  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2104  aldehyde dehydrogenase  51.63 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0366  aldehyde dehydrogenase  50.82 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141497  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2779  aldehyde dehydrogenase  50.41 
 
 		 506 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2539  aldehyde dehydrogenase  49.59 
 
 		 506 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03443  aldehyde dehydrogenase B  50 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4086  aldehyde dehydrogenase B  50 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2986  aldehyde dehydrogenase family protein  50.61 
 
 		 506 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3320  aldehyde dehydrogenase family protein  50.61 
 
 		 539 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1552  aldehyde dehydrogenase family protein  50.61 
 
 		 539 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>