More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0072 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3310  aldehyde dehydrogenase  65.65 
 
 
506 aa  671    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1414  aldehyde dehydrogenase  63.82 
 
 
506 aa  684    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03443  aldehyde dehydrogenase B  62.4 
 
 
512 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0120  Aldehyde Dehydrogenase  62.4 
 
 
512 aa  665    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0545  aldehyde dehydrogenase family protein  65.31 
 
 
506 aa  668    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5650  aldehyde dehydrogenase  68.9 
 
 
507 aa  738    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260352  hitchhiker  0.00474068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2680  aldehyde dehydrogenase family protein  63.89 
 
 
506 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00858732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6715  aldehyde dehydrogenase  68.21 
 
 
514 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.140744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3423  aldehyde dehydrogenase  69.51 
 
 
507 aa  743    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0352428  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3128  putative NAD+ dependent acetaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  63.89 
 
 
506 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3281  aldehyde dehydrogenase  64.84 
 
 
505 aa  662    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0364  aldehyde dehydrogenase  66.94 
 
 
506 aa  699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.601797  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0248  aldehyde dehydrogenase  67.14 
 
 
506 aa  699    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1885  aldehyde dehydrogenase family protein  62.6 
 
 
506 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0599  aldehyde dehydrogenase  67.28 
 
 
506 aa  710    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213204  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0202  aldehyde dehydrogenase family protein  69.7 
 
 
505 aa  712    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4480  aldehyde dehydrogenase  67.34 
 
 
506 aa  705    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0194  aldehyde dehydrogenase family protein  69.7 
 
 
505 aa  710    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0728  aldehyde dehydrogenase family protein  66.53 
 
 
506 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4008  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  68.7 
 
 
539 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1862  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  62.88 
 
 
506 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3936  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  68.7 
 
 
570 aa  702    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1159  aldehyde dehydrogenase  68.9 
 
 
506 aa  707    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0957  aldehyde dehydrogenase  67.07 
 
 
501 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.289465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0366  aldehyde dehydrogenase  66.46 
 
 
506 aa  702    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141497  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2986  aldehyde dehydrogenase family protein  68.7 
 
 
506 aa  702    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1192  aldehyde dehydrogenase  69.64 
 
 
508 aa  746    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2260  aldehyde dehydrogenase  68.9 
 
 
502 aa  732    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0248  aldehyde dehydrogenase  67.14 
 
 
506 aa  699    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0584  aldehyde dehydrogenase  65.11 
 
 
506 aa  666    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0629  aldehyde dehydrogenase  67.14 
 
 
506 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1612  aldehyde dehydrogenase family protein, NAD dependent  68.77 
 
 
508 aa  722    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1008  aldehyde dehydrogenase  67.28 
 
 
506 aa  722    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3678  aldehyde dehydrogenase  69.92 
 
 
506 aa  727    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0138  acetaldehyde dehydrogenase  68.7 
 
 
506 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3574  aldehyde dehydrogenase  66.73 
 
 
506 aa  703    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2916  aldehyde dehydrogenase  73.35 
 
 
519 aa  783    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.155375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0143  lactaldehyde dehydrogenase  62.2 
 
 
512 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4989  aldehyde dehydrogenase  66.33 
 
 
520 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1095  aldehyde dehydrogenase  66.87 
 
 
506 aa  708    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1552  aldehyde dehydrogenase family protein  68.7 
 
 
539 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3314  aldehyde dehydrogenase  63.01 
 
 
508 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4086  aldehyde dehydrogenase B  62.6 
 
 
512 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0620  aldehyde dehydrogenase  66.06 
 
 
507 aa  682    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726946  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0251  aldehyde dehydrogenase  67.14 
 
 
506 aa  699    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0931  aldehyde dehydrogenase  66.67 
 
 
506 aa  707    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3247  aldehyde dehydrogenase family protein  68.9 
 
 
506 aa  705    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0132  aldehyde dehydrogenase  63.41 
 
 
508 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239078  normal  0.798245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2866  aldehyde dehydrogenase  67.89 
 
 
506 aa  710    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1964  aldehyde dehydrogenase  64.29 
 
 
506 aa  693    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1995  lactaldehyde dehydrogenase  68.13 
 
 
506 aa  726    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000162834  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4570  aldehyde dehydrogenase  67.48 
 
 
506 aa  704    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1085  acetaldehyde dehydrogenase 2  65.72 
 
 
506 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4441  aldehyde dehydrogenase  67.89 
 
 
506 aa  728    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.896432  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0305  aldehyde dehydrogenase  66.26 
 
 
532 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045358  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2339  aldehyde dehydrogenase  65.52 
 
 
506 aa  686    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3050  aldehyde dehydrogenase family protein  68.7 
 
 
539 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0703  aldehyde dehydrogenase  67.87 
 
 
506 aa  731    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481981  normal  0.0197886 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1844  aldehyde dehydrogenase  68.18 
 
 
508 aa  719    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0895  aldehyde dehydrogenase  66.06 
 
 
501 aa  651    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0344  aldehyde dehydrogenase  62.6 
 
 
541 aa  662    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5128  aldehyde dehydrogenase  63.69 
 
 
506 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768113  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3272  aldehyde dehydrogenase  67.28 
 
 
507 aa  692    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.329246  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10465  aldehyde dehydrogenase  63.82 
 
 
507 aa  661    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3621  aldehyde dehydrogenase  69.11 
 
 
506 aa  724    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.096261 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2454  aldehyde dehydrogenase  62.97 
 
 
506 aa  679    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2921  aldehyde dehydrogenase  63.01 
 
 
553 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.965881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0627  aldehyde dehydrogenase  66.06 
 
 
507 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0914796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1874  aldehyde dehydrogenase  63.89 
 
 
506 aa  677    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.880789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3514  aldehyde dehydrogenase  68.97 
 
 
506 aa  724    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192825  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02420  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  64.91 
 
 
506 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0249  aldehyde dehydrogenase  67.34 
 
 
506 aa  704    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1964  aldehyde dehydrogenase  65.04 
 
 
506 aa  662    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00163057  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3942  aldehyde dehydrogenase  65.72 
 
 
506 aa  688    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3772  aldehyde dehydrogenase  67.34 
 
 
506 aa  704    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2726  aldehyde dehydrogenase  68.7 
 
 
506 aa  728    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0124  aldehyde dehydrogenase  63.62 
 
 
508 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4952  aldehyde dehydrogenase  67.48 
 
 
507 aa  662    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117167  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0269  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  65.11 
 
 
506 aa  686    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11810  putative aldehyde dehydrogenase  65.92 
 
 
506 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.549334  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38840  NAD+ dependent acetaldehyde dehydrogenase  65.85 
 
 
506 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970566  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3320  aldehyde dehydrogenase family protein  68.7 
 
 
539 aa  702    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3088  aldehyde dehydrogenase  66.87 
 
 
507 aa  712    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0134  aldehyde dehydrogenase  63.01 
 
 
508 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.723965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3793  aldehyde dehydrogenase B  62.4 
 
 
512 aa  666    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0250  aldehyde dehydrogenase  67.34 
 
 
506 aa  705    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000231621 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1743  aldehyde dehydrogenase  69.11 
 
 
510 aa  722    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.356193  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2366  aldehyde dehydrogenase  69.51 
 
 
508 aa  729    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3083  aldehyde dehydrogenase  63.89 
 
 
506 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2092  aldehyde dehydrogenase  67.21 
 
 
507 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602345  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2967  aldehyde dehydrogenase  75.86 
 
 
501 aa  810    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.339954  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0271  aldehyde dehydrogenase  70.51 
 
 
505 aa  721    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3435  aldehyde dehydrogenase  68.09 
 
 
506 aa  704    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.256643 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0640  aldehyde dehydrogenase  66.06 
 
 
507 aa  682    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2539  aldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 
506 aa  658    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1468  aldehyde dehydrogenase  67.89 
 
 
507 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.776481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3410  aldehyde dehydrogenase  64.84 
 
 
506 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3230  aldehyde dehydrogenase  68.74 
 
 
506 aa  750    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.836096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3013  aldehyde dehydrogenase  66.87 
 
 
506 aa  668    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1890  aldehyde dehydrogenase  68.36 
 
 
507 aa  739    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.943834  normal  0.754325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>