16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0800 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0800  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  517  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0824  hypothetical protein  97.95 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131616  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0839  hypothetical protein  90.98 
 
 		 244 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4386  hypothetical protein  79.6 
 
 		 250 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4657  hypothetical protein  59.09 
 
 		 249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1320  hypothetical protein  58.26 
 
 		 250 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1137  hypothetical protein  56.38 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.290114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1262  protein of unknown function UPF0153  55.06 
 
 		 254 aa  278  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1855  hypothetical protein  40 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5497  protein of unknown function UPF0153  38.65 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.30539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4406  hypothetical protein  34.9 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4987  hypothetical protein  34.1 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6825  hypothetical protein  36.03 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5135  protein of unknown function UPF0153  42.41 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>