26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1810 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1810  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 254 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0109813  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05341  short chain dehydrogenase  96.46 
 
 		 254 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.118311 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04781  short chain dehydrogenase  51.98 
 
 		 257 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.864402 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06851  short chain dehydrogenase  49.15 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1713  short chain dehydrogenase  45.96 
 
 		 249 aa  221  6e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0646  short chain dehydrogenase  47.9 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05031  short chain dehydrogenase  52.81 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05331  short chain dehydrogenase  51.95 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.647746  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0478  short chain dehydrogenase  49.13 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1743  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  43.22 
 
 		 409 aa  181  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.505987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05411  short chain dehydrogenase  45.18 
 
 		 238 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0882215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3384  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  41.1 
 
 		 404 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0842787 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0861  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 429 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589823  normal  0.0593314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0598  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  40.68 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0613  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  40.68 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3742  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 420 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843241  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4290  fatty acid hydroxylase  38.78 
 
 		 412 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.08 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.85 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.396766  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  31.93 
 
 		 276 aa  45.4  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_12277  hypothetical protein  23.92 
 
 		 423 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.28 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.53 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.550294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.98 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22780  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  25 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>