18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1234 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1234  putative dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137269  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000290359  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1285  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.33 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1661  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.24 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1870  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.4 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.151369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0747  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.7 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0790  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.09 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.537712  hitchhiker  0.00444218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2734  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.22 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0727  carbohydrate oxidoreductase, putative  25.6 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3512  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.63 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000550533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2247  carbohydrate oxidoreductase, putative  25.7 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4585  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.4 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1263  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.8 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.818753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3714  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.19 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.736415  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02230  conserved hypothetical protein  28.67 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0219255  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08032  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02240)  26.47 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.019625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1727  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  20.61 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2594  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.74 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>