15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0621 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0621  hydrogenase accessory membrane protein  100 
 
 
210 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14481  hypothetical protein  94.12 
 
 
204 aa  344  6e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03731  hypothetical protein  68.48 
 
 
209 aa  241  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1592  putative hydrogenase accessory protein  63.69 
 
 
210 aa  229  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.150539  hitchhiker  0.00246904 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2011  putative hydrogenase accessory protein  66.67 
 
 
210 aa  222  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12311  putative hydrogenase accessory protein  55.61 
 
 
234 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21111  putative hydrogenase accessory protein  56.68 
 
 
187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.543051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1026  HupE/UreJ protein  32.54 
 
 
226 aa  78.2  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2095  HupE/UreJ protein  34.64 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2139  HupE/UreJ protein  33.52 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3141  hypothetical protein  36.75 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4228  HupE/UreJ protein  32.98 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1373  hydrogenase accessory protein  29.72 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.695906  normal  0.247708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5052  HupE/UreJ protein  34.97 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.864731  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3268  urease accessory protein  29.69 
 
 
192 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>