33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0491 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0491  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.802373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12141  hypothetical protein  98.39 
 
 
186 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16901  hypothetical protein  54.84 
 
 
189 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1224  hypothetical protein  50.27 
 
 
186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1258  hypothetical protein  53.18 
 
 
186 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08341  hypothetical protein  54.6 
 
 
182 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0780  hypothetical protein  55.17 
 
 
182 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388064  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08101  hypothetical protein  51.91 
 
 
191 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0178  hypothetical protein  51.37 
 
 
193 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08321  hypothetical protein  54.02 
 
 
182 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08111  hypothetical protein  53.18 
 
 
182 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09901  hypothetical protein  45.83 
 
 
165 aa  160  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.133858  normal  0.286741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.03 
 
 
494 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.23 
 
 
491 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.23 
 
 
491 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  31.03 
 
 
500 aa  81.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49580  predicted protein  31.36 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  33.14 
 
 
493 aa  79.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.03 
 
 
494 aa  79  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.16 
 
 
500 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17110  predicted protein  28.09 
 
 
212 aa  62  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0710818  normal  0.446796 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36846  predicted protein  29.75 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.71 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  24.2 
 
 
179 aa  51.2  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1723  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.67 
 
 
172 aa  48.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  23.57 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2199  hypothetical protein  26.59 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  26.77 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  25.83 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.48 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.48 
 
 
178 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.48 
 
 
178 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.94 
 
 
170 aa  41.2  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>