16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80516 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00261  Protein transport protein sec23 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGR9]  56.88 
 
 		 771 aa  882    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115458 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01150  hypothetical protein  59.32 
 
 		 763 aa  943    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.966337  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80516  component of COPII coat of ER- Golgi vesicles  100 
 
 		 749 aa  1552    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.461247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16541  predicted protein  43.77 
 
 		 770 aa  642    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.700638  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33543  predicted protein  41.81 
 
 		 771 aa  653    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0336143  normal  0.164519 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42673  predicted protein  47.13 
 
 		 759 aa  685    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76723  predicted protein  42.68 
 
 		 816 aa  622  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.322437 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53063  predicted protein  25.33 
 
 		 897 aa  256  1.0000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47270  predicted protein  19.61 
 
 		 897 aa  79.7  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48220  predicted protein  23.33 
 
 		 1041 aa  77  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313872  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88822  predicted protein  19.67 
 
 		 774 aa  67  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  decreased coverage  0.00889443 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00260  ER to Golgi transport-related protein, putative  21.89 
 
 		 920 aa  61.2  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00276078  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13396  predicted protein  21.39 
 
 		 680 aa  61.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44386  predicted protein  21.32 
 
 		 777 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.704659  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03720  Protein transport protein sec24 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6W0]  19.64 
 
 		 908 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03080  vesicle coat complex COPII, subunit Sec24 family protein, putative (Eurofung)  20.07 
 
 		 1031 aa  43.9  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0488022  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>