12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48494 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_48494  60S ribosomal protein L13  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593553 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07003  60S ribosomal protein L13 (AFU_orthologue; AFUA_4G04460)  51.33 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01020  ribosomal protein L13, putative  48.04 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243164  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15603  Ribosomal protein L13, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.16 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15619  predicted protein  39.43 
 
 		 171 aa  111  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0678  ribosomal protein L13  49.12 
 
 		 144 aa  57  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1663  ribosomal protein L13  40.3 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.129766  hitchhiker  0.00645105 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0690  ribosomal protein L13  32.19 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0734  ribosomal protein L13  41.1 
 
 		 157 aa  48.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0451901  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0588  50S ribosomal protein L13E  39.71 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1980  ribosomal protein L13  32.5 
 
 		 158 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.280522  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0248  Ribosomal protein L13e  34.18 
 
 		 110 aa  42.4  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>