18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46656 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46656  predicted protein  100 
 
 		 531 aa  1089    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03980  translation initiation factor, putative  28.97 
 
 		 543 aa  73.6  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00811612  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00978  eukaryotic translation initiation factor subunit eIF2B-gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16660)  23.18 
 
 		 582 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.903663  normal  0.846946 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64224  translation initiation factor eIF2B subunit  33.33 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167221  normal  0.261571 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  35.14 
 
 		 399 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31337  predicted protein  29.55 
 
 		 371 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10459  translation initiation factor eif-2b epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12530)  34.48 
 
 		 704 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81885  translation initiation factor eIF-2B epsilon subunit, GEF  24.39 
 
 		 726 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.541559  normal  0.64637 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0967  nucleotidyl transferase  23.36 
 
 		 407 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1974  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  23.81 
 
 		 434 aa  47.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1877  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  45.28 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  45.28 
 
 		 228 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1307  nucleotidyl transferase  30.56 
 
 		 413 aa  44.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  28.38 
 
 		 357 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  32.93 
 
 		 365 aa  43.5  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  46.43 
 
 		 400 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  40.74 
 
 		 254 aa  43.5  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>