46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51952 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_51952  class II CPD photolyase  100 
 
 		 511 aa  1071    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0767  deoxyribodipyrimidine photolyase  43.74 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0527  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  41.48 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30886  predicted protein  43.93 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.25268 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1961  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  42.83 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.351083  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0876  DNA photolyase, class 2  41.33 
 
 		 459 aa  349  7e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase  41.51 
 
 		 450 aa  349  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1775  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.93 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00154316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0179  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  41.04 
 
 		 487 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2829  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  39.96 
 
 		 461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36787  predicted protein  41.9 
 
 		 477 aa  334  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00684152  hitchhiker  0.00249943 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41733  predicted protein  41.9 
 
 		 477 aa  334  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  normal  0.188048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0415  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.57 
 
 		 452 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1321  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.74 
 
 		 469 aa  315  9e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.533615  normal  0.0703748 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2693  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.29 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0522  DNA photolyase, class 2  36.22 
 
 		 495 aa  307  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.372488 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2851  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.63 
 
 		 473 aa  289  7e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04990  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.03 
 
 		 466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1936  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.89 
 
 		 494 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4497  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  35.93 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.112755  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3500  DNA photolyase FAD-binding protein  33.68 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3129  DNA photolyase, FAD-binding  37.21 
 
 		 468 aa  249  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0663  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  37.24 
 
 		 464 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3221  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.61 
 
 		 448 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0725  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.4 
 
 		 455 aa  243  5e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2139  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.4 
 
 		 456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6363  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.66 
 
 		 465 aa  220  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3762  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.68 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12101  normal  0.44256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2459  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.5 
 
 		 467 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0155  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.95 
 
 		 476 aa  210  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2716  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.26 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2754  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.71 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.853539 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45715  predicted protein  31.61 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.380145  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2531  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.3 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1430  DNA photolyase FAD-binding protein  29.82 
 
 		 493 aa  193  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4973  DNA photolyase FAD-binding protein  37.64 
 
 		 496 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3226  DNA photolyase FAD-binding  36.65 
 
 		 486 aa  170  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3125  DNA photolyase FAD-binding  36.65 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848481  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3028  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  36.65 
 
 		 490 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3007  DNA photolyase FAD-binding  37.11 
 
 		 493 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  29.29 
 
 		 843 aa  156  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49165  predicted protein  28.73 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1907  DNA photolyase, class 2  32.5 
 
 		 104 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.47 
 
 		 476 aa  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.58 
 
 		 481 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1386  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.2 
 
 		 435 aa  44.3  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0285292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>