31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43593 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43593  predicted protein  100 
 
 
448 aa  943    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.131498  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1267  lipase, class 3  33.18 
 
 
261 aa  63.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05681  hypothetical protein  27.54 
 
 
271 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000058  lipase-related protein  28.29 
 
 
216 aa  59.7  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50397  predicted protein  27.09 
 
 
891 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  28.26 
 
 
234 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 
308 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28505  triacylglycerol lipase precursor  23.18 
 
 
350 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  29.88 
 
 
258 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0603  lipase, class 3  28.4 
 
 
319 aa  50.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  23.98 
 
 
294 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0692  lipase, class 3  27.31 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141463  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37711  predicted protein  28.86 
 
 
359 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  27.07 
 
 
240 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  27.62 
 
 
240 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  27.62 
 
 
240 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01560  lipase-related protein  29.71 
 
 
262 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  27.62 
 
 
240 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  27.07 
 
 
240 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  27.07 
 
 
240 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  27.07 
 
 
240 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  27.07 
 
 
240 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  27.07 
 
 
240 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  26.11 
 
 
240 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  36.36 
 
 
539 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  27.22 
 
 
277 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  40.24 
 
 
726 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  26.52 
 
 
240 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5346  lipase class 3  29.41 
 
 
343 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7157  lipase class 3  29.63 
 
 
291 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  27.19 
 
 
758 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>