22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0515 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0515  hypothetical protein  100 
 
 
531 aa  1102    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00486744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3004  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.92 
 
 
562 aa  173  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1357  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.94 
 
 
552 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.882864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1665  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.92 
 
 
568 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.785614  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  26.19 
 
 
556 aa  157  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2981  putative alkaline phosphatase  26.04 
 
 
571 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882941  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1818  hypothetical protein  25.27 
 
 
545 aa  154  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1819  hypothetical protein  25.18 
 
 
545 aa  153  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1165  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.86 
 
 
555 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0023  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.86 
 
 
539 aa  150  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3007  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.52 
 
 
557 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3006  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.29 
 
 
541 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0724  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.82 
 
 
545 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135671 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1743  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.39 
 
 
577 aa  140  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0812023  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3360  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.95 
 
 
548 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.263432  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0390  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.1 
 
 
531 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  normal  0.642333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2275  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.18 
 
 
544 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1377  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.46 
 
 
562 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4606  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.66 
 
 
583 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0044  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.71 
 
 
561 aa  55.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2397  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.68 
 
 
581 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2790  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.43 
 
 
565 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0567243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>