39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0228 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0228  DdaH family protein  100 
 
 
308 aa  637    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05885  DdaH family protein  53.57 
 
 
304 aa  334  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.542101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0366  amidinotransferase  47.68 
 
 
304 aa  295  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95225  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1455  amidinotransferase  46.58 
 
 
306 aa  290  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.652533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  28.63 
 
 
279 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2108  amidinotransferase  26.8 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  24.7 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0821  arginine deiminase  25.6 
 
 
319 aa  65.1  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208764  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  23.61 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  25.81 
 
 
294 aa  55.8  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6526  putative amidinotransferase family protein  25.88 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1949  arginine deiminase  28.16 
 
 
405 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000474348  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0416  Glycine amidinotransferase  23.31 
 
 
380 aa  53.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1118  arginine deiminase  24.19 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00592031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  25.2 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  22.81 
 
 
407 aa  49.7  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0451  arginine deiminase  26.19 
 
 
410 aa  49.3  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131772  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0181  Arginine deiminase  28.3 
 
 
405 aa  48.9  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0445  arginine deiminase  27.96 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000529267  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  28.36 
 
 
403 aa  48.1  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0871  arginine deiminase  22.92 
 
 
410 aa  47.8  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0203728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  27.12 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1457  arginine deiminase  22.49 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00237571  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0153  arginine deiminase  27.18 
 
 
405 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06650  arginine deiminase  24.77 
 
 
410 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000122198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  27.72 
 
 
293 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  23.99 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0420  arginine deiminase  25 
 
 
410 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4898  arginine deiminase  25 
 
 
410 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0472  arginine deiminase  25 
 
 
410 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0452  arginine deiminase  24.47 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0161  arginine deiminase  32.89 
 
 
413 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0157  arginine deiminase  32.89 
 
 
413 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  21.64 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0348  arginine deiminase  23.53 
 
 
410 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0407  arginine deiminase  24.73 
 
 
410 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.751468 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0341  arginine deiminase  24.73 
 
 
410 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  25.25 
 
 
406 aa  43.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2490  Arginine deiminase  24.22 
 
 
420 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>