17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1578 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2925  hypothetical protein  66.88 
 
 
495 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.665125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3194  hypothetical protein  66.88 
 
 
495 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1578  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  1032    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0579  hypothetical protein  53.31 
 
 
501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1741  hypothetical protein  53.21 
 
 
508 aa  528  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.230988  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2449  hypothetical protein  50.65 
 
 
528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000077314 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2357  hypothetical protein  45.9 
 
 
481 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  29.25 
 
 
515 aa  63.9  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  24.31 
 
 
911 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  27.11 
 
 
906 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  25.1 
 
 
906 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  25.1 
 
 
906 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1159  protein of unknown function DUF187  25.41 
 
 
551 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2561  protein of unknown function DUF187  24.71 
 
 
538 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  27.85 
 
 
380 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  21.94 
 
 
1099 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  25.68 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>