13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3857 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3857  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 354 aa  723    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2993  saccharopine dehydrogenase  38.81 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5612  saccharopine dehydrogenase  37.23 
 
 		 362 aa  232  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0770  saccharopine dehydrogenase  27.09 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4148  hypothetical protein  25.28 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4149  hypothetical protein  24.24 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  31.5 
 
 		 387 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  30.71 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  30.71 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  24.21 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  24.66 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  55.26 
 
 		 574 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  55.26 
 
 		 577 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>