66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2652 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  100 
 
 		 194 aa  397  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  47.14 
 
 		 211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  47.32 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  46.83 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  46.12 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  44.83 
 
 		 213 aa  177  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  44.61 
 
 		 211 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  47.4 
 
 		 193 aa  174  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  44.93 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  46.88 
 
 		 193 aa  173  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  45.41 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  43.92 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  43.92 
 
 		 273 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  43.92 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  43.92 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  43.39 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  43.35 
 
 		 205 aa  157  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  43.39 
 
 		 192 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  39.58 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  39.29 
 
 		 202 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  34.67 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  38.06 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  30.52 
 
 		 221 aa  95.5  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  33.16 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  39.1 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  32.28 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  32.29 
 
 		 217 aa  88.6  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2637  phage baseplate assembly protein V  32.29 
 
 		 241 aa  88.6  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616276  hitchhiker  0.000571581 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  34.1 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  34.1 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  29.92 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  32.94 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  32.94 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  29.63 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  30.05 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1204  phage baseplate assembly protein V  33.33 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  32.24 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2218  phage baseplate assembly protein V  33.33 
 
 		 301 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.033632  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  28.33 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  31.75 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  30.48 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  36.11 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  30.17 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0236  baseplate assembly protein V, putative  26.87 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  26.6 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4960  phage baseplate assembly protein V  29.17 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  26.72 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2296  baseplate assembly protein V  47.69 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2069  hypothetical protein  47.69 
 
 		 84 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543099  hitchhiker  0.0000457319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2183  baseplate assembly protein V, truncation  47.69 
 
 		 84 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2302  phage-related baseplate assembly protein V  39.78 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1500  Phage P2 baseplate assembly protein GPV-like protein  36.96 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4546  baseplate  26 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4461  tail spike  26 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4545  tail spike  25.68 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413404  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1294  phage baseplate assembly protein V  33.33 
 
 		 125 aa  51.6  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2384  Phage-related baseplate assembly protein V  38.55 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0194  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3333  Phage-related baseplate assembly protein V  36.14 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2324  hypothetical protein  37.08 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.711911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  26.39 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0590  phage baseplate assembly protein V  28.95 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22100  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406161  unclonable  3.23411e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  22.16 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  26.71 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1139  Phage baseplate assembly protein V  27.78 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>