88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1762 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2291  exonuclease I  72.67 
 
 		 476 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.057719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2627  exonuclease I  71.82 
 
 		 476 aa  721    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0145209  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2420  exonuclease I  78.09 
 
 		 476 aa  789    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2149  exonuclease I  73.89 
 
 		 475 aa  732    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2302  exonuclease I  73.89 
 
 		 475 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3214  exonuclease I  76.84 
 
 		 475 aa  778    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.650627  normal  0.0240807 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3083  exonuclease I  77.45 
 
 		 487 aa  785    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2516  exonuclease I  77.66 
 
 		 476 aa  787    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1629  exonuclease I  73.89 
 
 		 475 aa  732    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.186939 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1049  exonuclease I  74.31 
 
 		 475 aa  736    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.106186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1221  exonuclease I  74.31 
 
 		 475 aa  733    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.171451  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2244  exonuclease I  72.67 
 
 		 476 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0792988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2293  exonuclease I  72.61 
 
 		 476 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.083506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2191  exonuclease I  72.67 
 
 		 476 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.343372  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2404  exonuclease I  72.67 
 
 		 476 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.191485 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2944  exonuclease I  74.2 
 
 		 474 aa  733    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000391872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2211  exonuclease I  78.18 
 
 		 476 aa  799    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01900  hypothetical protein  74.31 
 
 		 475 aa  734    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2313  exonuclease I  78.18 
 
 		 476 aa  802    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1762  exonuclease I  100 
 
 		 475 aa  986    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2034  exonuclease I  94.95 
 
 		 475 aa  946    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01914  exonuclease I  74.31 
 
 		 475 aa  734    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1646  Exodeoxyribonuclease I  74.31 
 
 		 475 aa  734    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02119  exonuclease I  61.05 
 
 		 473 aa  610  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003696  exodeoxyribonuclease I  60.63 
 
 		 473 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0855  exonuclease I  60.04 
 
 		 474 aa  597  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1680  exonuclease I  57.26 
 
 		 474 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0872  exonuclease I  55.44 
 
 		 486 aa  549  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.759367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2014  exonuclease I  54.17 
 
 		 487 aa  532  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2617  exonuclease I  54.2 
 
 		 470 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13081  hitchhiker  0.0000541191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2487  exonuclease I  55.88 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1611  exonuclease I  55.53 
 
 		 482 aa  526  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2572  exonuclease I  54.78 
 
 		 470 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.731492  normal  0.440521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2049  exonuclease I  53.57 
 
 		 470 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0380557  normal  0.0388906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2410  exonuclease I  54.56 
 
 		 470 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.210191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2480  exonuclease I  54.78 
 
 		 470 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2790  exonuclease I  54.99 
 
 		 470 aa  521  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1569  exonuclease I  53.99 
 
 		 470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.856222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2662  exonuclease I  54.2 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00905803  hitchhiker  0.00509909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2287  exonuclease I  53.15 
 
 		 470 aa  514  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1973  exonuclease I  54.41 
 
 		 470 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464064  hitchhiker  0.00304849 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1638  exonuclease I  52.34 
 
 		 473 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.073476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1695  exonuclease I  54.37 
 
 		 472 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.856204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1717  exonuclease I  54.37 
 
 		 472 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.25005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1680  exonuclease I  54.16 
 
 		 472 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2172  exodeoxyribonuclease I  48.52 
 
 		 476 aa  472  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.585102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4316  exodeoxyribonuclease I  52.24 
 
 		 476 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117686  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2436  exodeoxyribonuclease I  50.11 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38320  exonuclease I  50.21 
 
 		 476 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56080  exonuclease I  53.19 
 
 		 480 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4884  exonuclease I  53.46 
 
 		 478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3314  exonuclease I  52.83 
 
 		 481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1005  exonuclease I  51.61 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000425826  hitchhiker  0.00000000000101458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3024  exonuclease I  48.94 
 
 		 495 aa  450  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.377058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1365  exonuclease I  52.74 
 
 		 477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0498448  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02405  exodeoxyribonuclease I  45.99 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.365933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4020  exonuclease I  52.98 
 
 		 476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.036552  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4359  exonuclease I  52.74 
 
 		 477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000903496  normal  0.0362727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4449  exonuclease I  52.07 
 
 		 477 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484535  hitchhiker  0.0000188223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2394  exonuclease I  45.88 
 
 		 485 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2380  exodeoxyribonuclease I  45.78 
 
 		 484 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2602  exonuclease I  49.16 
 
 		 482 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0809104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4438  exonuclease I  49.54 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2713  exonuclease I  48.64 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3059  exonuclease I  46.54 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3405  exonuclease I  46.56 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2653  exonuclease I  47.38 
 
 		 479 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1360  exonuclease I  46.12 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3125  exonuclease I  48.58 
 
 		 477 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3236  exonuclease I  48.12 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  normal  0.286488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2382  exonuclease I  45.68 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3505  exonuclease I  45.82 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584521  normal  0.826797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1838  exonuclease I  47.39 
 
 		 479 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510838  normal  0.42873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2939  exonuclease I  45.83 
 
 		 480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.66947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00762  exonuclease I  45.68 
 
 		 481 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485604  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1689  exonuclease I  46.97 
 
 		 479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2072  exonuclease I  45.99 
 
 		 485 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0682352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1935  exonuclease I  46.04 
 
 		 482 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0837  exonuclease I  43.46 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2600  exonuclease I  45.03 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186824  normal  0.262896 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0954  exonuclease I  42.83 
 
 		 488 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0266  exonuclease I  42.62 
 
 		 481 aa  350  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1071  Exodeoxyribonuclease I  37.76 
 
 		 495 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1518  exonuclease  31.21 
 
 		 458 aa  130  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1451  exodeoxyribonuclease I  31.21 
 
 		 458 aa  130  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1822  exodeoxyribonuclease I  26.73 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0928  hypothetical protein  26.87 
 
 		 228 aa  50.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0528  exonuclease  27.14 
 
 		 197 aa  47.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00892328  normal  0.16034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>