18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_69620 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_69620  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596016  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6015  hypothetical protein  87.32 
 
 
238 aa  339  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2070  hypothetical protein  47.76 
 
 
274 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2094  hypothetical protein  46.83 
 
 
274 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.390033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3749  hypothetical protein  53.63 
 
 
223 aa  184  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3767  hypothetical protein  44.1 
 
 
279 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1598  hypothetical protein  39.89 
 
 
266 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04797  hypothetical protein  41.25 
 
 
232 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0269206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0509  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2588  conserved hypothetical protein  31.76 
 
 
280 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.771938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1045  hypothetical protein  43.59 
 
 
159 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.85631 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6027  hypothetical protein  29.45 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419545  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3301  hypothetical protein  37.29 
 
 
274 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5210  hypothetical protein  34.92 
 
 
153 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.765726  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5309  hypothetical protein  36.07 
 
 
486 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00173209  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3578  hypothetical protein  38.1 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3811  hypothetical protein  27.71 
 
 
187 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.379378 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47553  predicted protein  30.77 
 
 
537 aa  41.6  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>