50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_04160 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  100 
 
 		 329 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  96.45 
 
 		 310 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  56.68 
 
 		 306 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  57.89 
 
 		 305 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  59.86 
 
 		 306 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5291  hypothetical protein  58.42 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4849  SdiA-regulated  57.79 
 
 		 314 aa  338  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  56.11 
 
 		 306 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5384  SdiA-regulated  60.89 
 
 		 307 aa  335  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  51.94 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  47.97 
 
 		 305 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  43.54 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  42.65 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  41.91 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  42.28 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  40.88 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  42.01 
 
 		 303 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  42.32 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  42.32 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  41.57 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  42.69 
 
 		 317 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  38.24 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  41.73 
 
 		 312 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  37.13 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  37.14 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  38.75 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  32.62 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  34.98 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  34.57 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  34.57 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  34.57 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  34.57 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  30.57 
 
 		 286 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  29.93 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  30.19 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  30.19 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  30.19 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  30.19 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  30.19 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  30.19 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  28.08 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  32.74 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  32.74 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4679  hypothetical protein  31.86 
 
 		 282 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  30.63 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  28 
 
 		 272 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  25.54 
 
 		 930 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  26.92 
 
 		 676 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  22.95 
 
 		 751 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  21.24 
 
 		 363 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>