176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_tRNAValVIMSS1309267 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309267  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0016  tRNA-Val  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0028  tRNA-Val  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.13979  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0024  tRNA-Val  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0046  tRNA-Val  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.146675 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0013  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0014  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0026  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.851542  hitchhiker  0.00348632 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0044  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.311014  normal  0.10516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0029  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198673  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1386  tRNA-Val  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0550643 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0026  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000991337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0009  tRNA-Val  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000243389  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0018  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0054  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.452754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0093  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15510  tRNA-Val  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0008  tRNA-Val  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000957098  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1385  tRNA-Val  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0561605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0037  tRNA-Val  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0027  tRNA-Val  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000730329  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13860  tRNA-Val  89.36 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0312518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0020  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0496105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t10  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0829003  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0027  tRNA-Pro  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.719402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0057  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.700226  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0014  tRNA-Pro  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0007  tRNA-Pro  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0615  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.394292  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0018  tRNA-Pro  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.471036  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0019  tRNA-Pro  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0052  tRNA-Pro  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0774  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11857  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0031  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t01  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t01  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA1  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0018  tRNA-Val  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0087  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R7  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365989  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0026  tRNA-Val  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.289153  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0041  tRNA-Val  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0024  tRNA-Val  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0009  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0024  tRNA-Val  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0036  tRNA-Val  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120511 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1555  tRNA-Val  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03410  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000139149  hitchhiker  1.96604e-19 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0038  tRNA-Val  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666126  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0086  tRNA-Asn  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0040  tRNA-Val  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.90959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0076  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77205  normal  0.0987165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16810  tRNA-Val  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606714  normal  0.0176901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0033  tRNA-Val  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0641219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600099  normal  0.289188 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0024  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.508678  normal  0.235406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0041  tRNA-Val  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0784234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA40  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0135525  normal  0.0275356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.964403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0340  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt16  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0045  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00710383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0069  tRNA-Val  87.23 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00232154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t42  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000750468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1637  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.590858  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0032  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297766  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0021  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0049  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0016  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0055  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0679296  normal  0.0243248 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0030  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0005  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0052  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222044  normal  0.0244207 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>