28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4348 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4348  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.915436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  35.04 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4233  hypothetical protein  33.11 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  29.51 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1830  hypothetical protein  31.76 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1551  hypothetical protein  31.76 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.670721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1690  hypothetical protein  31.76 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0348  hypothetical protein  30.27 
 
 		 319 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2074  hypothetical protein  32.12 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7552  hypothetical protein  29.75 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0606564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  31.17 
 
 		 274 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  31.17 
 
 		 274 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3141  hypothetical protein  26.02 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  29.37 
 
 		 321 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1484  hypothetical protein  32.29 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000292957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3870  hypothetical protein  26.39 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5620  nutrient deprivation-induced protein  28.07 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.188949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3877  hypothetical protein  28.91 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.65728  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  30.23 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34610  hypothetical protein  33.03 
 
 		 263 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1246  hypothetical protein  27.27 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.96129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1322  hypothetical protein  27.89 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0522  hypothetical protein  30.89 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2209  hypothetical protein  32.31 
 
 		 162 aa  45.1  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5261  putative nutrient deprivation-induced protein  26.19 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2224  hypothetical protein  29.41 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0974  hypothetical protein  30.19 
 
 		 146 aa  41.6  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>