13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0534 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0534  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  736    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.656053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3047  hypothetical protein  54.45 
 
 		 292 aa  342  8e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2180  hypothetical protein  28.53 
 
 		 358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2293  hypothetical protein  28.05 
 
 		 358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.120131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3017  hypothetical protein  39.29 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000253607  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4505  hypothetical protein  31.47 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.133384 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2916  hypothetical protein  36.78 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3771  hypothetical protein  35.63 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3578  hypothetical protein  31.03 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4229  hypothetical protein  31.03 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  27.47 
 
 		 994 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0601  hypothetical protein  24.83 
 
 		 208 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.28476  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1906  hypothetical protein  28.12 
 
 		 203 aa  43.1  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>