21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3117 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3117  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  337  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0267  hypothetical protein  75.29 
 
 
174 aa  268  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.708651  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0291  hypothetical protein  75.29 
 
 
174 aa  268  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6297  hypothetical protein  51.19 
 
 
168 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4780  hypothetical protein  41.92 
 
 
180 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472606  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4477  hypothetical protein  46.56 
 
 
181 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.320227  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4327  hypothetical protein  46.56 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457545  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1002  hypothetical protein  46.67 
 
 
181 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4227  hypothetical protein  43.41 
 
 
177 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2387  putative lipid carrier protein-like protein  42.86 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0557516 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0466  hypothetical protein  41.96 
 
 
174 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2118  hypothetical protein  41.96 
 
 
174 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3004  putative lipid carrier protein-like protein  40.87 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4295  putative lipid carrier protein-like  41.1 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3474  hypothetical protein  36.07 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.498948  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2400  putative lipid carrier protein-like protein  31.86 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  29.45 
 
 
227 aa  47.4  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2786  sterol-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
170 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0607  hypothetical protein  25.64 
 
 
172 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  26.87 
 
 
204 aa  40.8  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  26.87 
 
 
204 aa  40.8  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>