18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_86630 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_86630  predicted protein  100 
 
 
1151 aa  2363    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.460388  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_813  predicted protein  31.01 
 
 
719 aa  83.2  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0197823  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41455  predicted protein  34.02 
 
 
366 aa  83.2  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.291045  normal  0.0210228 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01230  response to pH-related protein, putative  29.18 
 
 
968 aa  77.8  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56356  predicted protein  28.19 
 
 
2283 aa  75.9  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.614914 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16408  predicted protein  33.19 
 
 
252 aa  74.3  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00239  Beige/BEACH domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09220)  30.2 
 
 
2483 aa  73.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.996444  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13399  predicted protein  28.81 
 
 
252 aa  71.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10805  predicted protein  30.71 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.689301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.08 
 
 
1557 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.39 
 
 
1411 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9886  predicted protein  29.1 
 
 
231 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  19.64 
 
 
578 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00305  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit Dip2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02680)  25.95 
 
 
963 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140894  normal  0.864535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  27.07 
 
 
1484 aa  45.8  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.53 
 
 
947 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48240  Receptor of activated protein kinase C 1B, component of 40S small ribosomal subunit  32.56 
 
 
321 aa  44.7  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19794  Receptor of activated protein kinase C 1A, component of 40S small ribosomal subunit  32.56 
 
 
321 aa  44.7  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>