22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_44277 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009365  OSTLU_44277  predicted protein  100 
 
 
368 aa  766    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_3060  predicted protein  33.63 
 
 
346 aa  159  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.206644  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10962  interstrand crosslink repair protein (Eurofung)  27.71 
 
 
832 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47094  predicted protein  30.22 
 
 
503 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32290  predicted protein  36.44 
 
 
684 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04070  conserved hypothetical protein  34.01 
 
 
811 aa  95.1  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.96924  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56782  predicted protein  24.45 
 
 
628 aa  88.6  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01200  expressed protein  23.43 
 
 
758 aa  80.1  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_17702  predicted protein  23.86 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.257016 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40815  predicted protein  35.33 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0533421  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  21.7 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  22.4 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29160  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  31.21 
 
 
561 aa  47  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.813951  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  20.74 
 
 
315 aa  47  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0161  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.826932  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.89 
 
 
561 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3400  exonuclease of the beta-lactamase fold class-like protein  29.55 
 
 
791 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
561 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  26.43 
 
 
813 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  23.92 
 
 
555 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  23.77 
 
 
561 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  20.64 
 
 
636 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>