245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2942 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  100 
 
 
124 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  100 
 
 
124 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  100 
 
 
124 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  100 
 
 
124 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  100 
 
 
124 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  247  4e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  247  4e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  99.19 
 
 
124 aa  247  4e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  90.7 
 
 
129 aa  230  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  95.76 
 
 
121 aa  227  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  94.17 
 
 
133 aa  224  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  85.37 
 
 
124 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  84.55 
 
 
124 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  84.55 
 
 
124 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  83.87 
 
 
124 aa  209  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  79.84 
 
 
124 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  79.84 
 
 
124 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  78.51 
 
 
128 aa  192  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  72.36 
 
 
124 aa  185  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  84.26 
 
 
109 aa  184  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  74.17 
 
 
124 aa  184  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  74.17 
 
 
124 aa  184  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  72.36 
 
 
124 aa  183  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  73.91 
 
 
125 aa  174  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  64.22 
 
 
134 aa  155  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  64.22 
 
 
134 aa  155  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  64.22 
 
 
134 aa  155  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  64.22 
 
 
134 aa  155  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  73.74 
 
 
99 aa  149  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  94.12 
 
 
94 aa  135  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4724  transposase IS3/IS911  67.69 
 
 
71 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240633  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1261  transposase IS3/IS911  86.54 
 
 
53 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2450  transposase IS3/IS911  83.93 
 
 
57 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5095  hypothetical protein  80.36 
 
 
57 aa  87  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.72528 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5091  hypothetical protein  71.7 
 
 
64 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.774813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  35.11 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
374 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 
374 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  35.48 
 
 
374 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  35.48 
 
 
374 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  35.48 
 
 
374 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
374 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  35.48 
 
 
374 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3375  hypothetical protein  87.5 
 
 
43 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1370  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.885273  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18320  hypothetical protein  38.89 
 
 
105 aa  52  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1842  transposase IS3/IS911 family protein  31.63 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0537  putative transposase  29.59 
 
 
102 aa  50.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1352  putative transposase  29.59 
 
 
102 aa  50.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1382  putative transposase or inactivated derivative  29.59 
 
 
102 aa  50.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  32.32 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4500  transposase IS3/IS911 family protein  29.41 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  31.31 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  32.32 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4376  transposase IS3/IS911  29.41 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  31.31 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  32.98 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  32.98 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  32.43 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08186  transposase  31.18 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.0000609698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2349  transposase IS3/IS911 family protein  37.65 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0590216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2124  putative transposase  29.03 
 
 
101 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08182  transposase  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000279853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01502  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01667  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01093  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01947  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02147  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01863  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02814  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05620  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02887  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02439  hypothetical protein  31.18 
 
 
96 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05659  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05751  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05741  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05649  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06015  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06182  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06081  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02413  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>