50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0950 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
277 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  93.73 
 
 
298 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  86.91 
 
 
277 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  83.27 
 
 
277 aa  461  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  83.75 
 
 
277 aa  461  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  85.4 
 
 
276 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  82.78 
 
 
276 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  82.12 
 
 
276 aa  447  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  81.02 
 
 
273 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.8 
 
 
270 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.32 
 
 
277 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.32 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  46.25 
 
 
269 aa  192  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.61 
 
 
270 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  41.61 
 
 
270 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.34 
 
 
270 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.51 
 
 
271 aa  186  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.7 
 
 
286 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.51 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.31 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  44.57 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.59 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.59 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.02 
 
 
268 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  34.93 
 
 
277 aa  168  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  38.49 
 
 
268 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  37.31 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.36 
 
 
276 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.23 
 
 
268 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.34 
 
 
268 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.57 
 
 
286 aa  156  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  34.33 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  26.67 
 
 
224 aa  53.1  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  25.34 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  25.71 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  32.52 
 
 
263 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  26.13 
 
 
242 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  27.14 
 
 
246 aa  46.2  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  33.96 
 
 
446 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  34.55 
 
 
231 aa  45.8  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  25.22 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  34.55 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  23.79 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  29.25 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  25.2 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  31.51 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  26.35 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  24.29 
 
 
239 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  25.23 
 
 
239 aa  42.7  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  25.95 
 
 
243 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>