More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4259 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  100 
 
 
332 aa  644    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  72.81 
 
 
334 aa  461  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  70.66 
 
 
385 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  73.64 
 
 
333 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  62.24 
 
 
336 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3421  phosphate transporter  68.22 
 
 
337 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0241  phosphate transporter  64.4 
 
 
334 aa  401  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2817  phosphate transporter  68.03 
 
 
334 aa  401  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33540  phosphate/sulfate permease  69.06 
 
 
334 aa  398  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0469788  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0871  phosphate transporter  67.51 
 
 
330 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0300  phosphate transporter  66.24 
 
 
332 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.942291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0326  phosphate transporter  61.77 
 
 
334 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0283  phosphate transporter  62.62 
 
 
334 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0849813 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2027  phosphate transporter  63.27 
 
 
333 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  53.01 
 
 
370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2744  phosphate transport protein  50.16 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0588425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  51.41 
 
 
336 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  50.61 
 
 
336 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  52.04 
 
 
337 aa  297  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  51.19 
 
 
336 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  51.19 
 
 
336 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  51.49 
 
 
336 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  52.06 
 
 
336 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  52.06 
 
 
336 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  54.86 
 
 
334 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  50.45 
 
 
336 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  50.45 
 
 
336 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  48.35 
 
 
332 aa  288  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  50.92 
 
 
326 aa  288  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  47.29 
 
 
329 aa  288  8e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  46.71 
 
 
332 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  48.21 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  52.22 
 
 
336 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  52.22 
 
 
336 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  48.05 
 
 
335 aa  285  8e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  51.55 
 
 
336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  51.55 
 
 
336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  51.55 
 
 
336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  50 
 
 
338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  48.8 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  49.51 
 
 
332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  46.43 
 
 
333 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  47.11 
 
 
332 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  51.59 
 
 
336 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  48.31 
 
 
333 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  47.43 
 
 
333 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  47.08 
 
 
332 aa  278  7e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  50.32 
 
 
336 aa  278  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  49.39 
 
 
336 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2000  phosphate transporter  49.7 
 
 
335 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1143  phosphate transporter  47.48 
 
 
380 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.639626  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  49.84 
 
 
333 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0911  phosphate transporter  49.25 
 
 
378 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  47.45 
 
 
335 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2217  phosphate transporter  46.27 
 
 
427 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  49.24 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3021  phosphate transporter  47.59 
 
 
332 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10556  low affinity inorganic phosphate transporter integral membrane protein pitA  47.34 
 
 
417 aa  272  6e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0205313  normal  0.167951 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0549  phosphate permease  45.92 
 
 
332 aa  272  7e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2395  phosphate transporter  50.46 
 
 
336 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38618  normal  0.093565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0563  phosphate transporter family protein  47.04 
 
 
332 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2876  phosphate transporter  45.48 
 
 
332 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2185  phosphate transporter family protein  50.47 
 
 
354 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1881  phosphate transporter  50.31 
 
 
336 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1398  phosphate transporter family protein  50.63 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0008  phosphate transporter family protein  50.63 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0756499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2245  phosphate transporter family protein  50.63 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1161  phosphate transporter family protein  50.63 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2284  phosphate transporter family protein  50.63 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  50.63 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2410  phosphate transporter family protein  50.47 
 
 
354 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0917  phosphate transporter  50.47 
 
 
336 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  normal  0.295731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5449  phosphate transporter  45.87 
 
 
386 aa  269  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0370554  normal  0.318098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  50.16 
 
 
336 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  50.78 
 
 
336 aa  268  8e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0678  phosphate transporter  50.31 
 
 
336 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  46.39 
 
 
336 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  43.75 
 
 
335 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  43.75 
 
 
335 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2626  phosphate transporter  48.87 
 
 
327 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0043  phosphate transporter  46.2 
 
 
331 aa  264  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5348  phosphate transporter  49.68 
 
 
336 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0728  phosphate transporter  45.64 
 
 
416 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.456434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0722  phosphate transporter  45.64 
 
 
416 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.163495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0742  phosphate transporter  45.64 
 
 
416 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0939  phosphate transporter  45.35 
 
 
427 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446978  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1152  phosphate transporter  49.09 
 
 
336 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1678  phosphate transporter  48.8 
 
 
334 aa  260  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397083  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1792  phosphate transporter  51.48 
 
 
336 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0188  phosphate transporter  44.84 
 
 
405 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449142  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2552  phosphate transporter  46.47 
 
 
354 aa  256  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.729981  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0762  phosphate transporter  44.95 
 
 
343 aa  256  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217274  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1056  phosphate transporter  41.74 
 
 
407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1527  phosphate transporter  44.21 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331212  normal  0.0143461 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2031  phosphate transporter  47.4 
 
 
334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  48.3 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0317  phosphate transporter family protein  42.64 
 
 
336 aa  253  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.178517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1684  phosphate transporter  46 
 
 
387 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00190537  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0708  phosphate transporter  45.3 
 
 
417 aa  251  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2335  phosphate transporter  46.85 
 
 
336 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.624995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>