More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3504 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3504  maf protein  100 
 
 
203 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0823  maf protein  61.24 
 
 
211 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.017605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3911  maf protein  63.33 
 
 
223 aa  225  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.487608  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7197  Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation-like protein  64.8 
 
 
257 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25490  MAF protein  56.36 
 
 
223 aa  214  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.124397  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1013  maf protein  54.75 
 
 
232 aa  214  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.374037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2443  maf protein  63.59 
 
 
195 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1035  maf protein  59.36 
 
 
221 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.611513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1140  maf protein  57.64 
 
 
229 aa  208  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0788  maf protein  58.16 
 
 
199 aa  204  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0851  maf protein  61.5 
 
 
226 aa  204  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0794  maf protein  60.5 
 
 
240 aa  201  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0145497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0836  Maf-like protein  48.48 
 
 
197 aa  194  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0679365  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0846  maf protein  55.77 
 
 
218 aa  191  7e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1128  Maf-like protein  47.47 
 
 
196 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0163  Maf-like protein  44.17 
 
 
204 aa  188  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.74208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0095  maf protein  47.03 
 
 
197 aa  186  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05870  Maf-like protein  50.46 
 
 
223 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.538428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4892  Maf-like protein  49.49 
 
 
195 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3574  Maf-like protein  46.19 
 
 
206 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4366  maf protein  53 
 
 
202 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2532  Maf-like protein  46.19 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1041  maf protein  50.72 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4232  maf protein  51.43 
 
 
219 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337108  normal  0.701882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1838  maf protein  50 
 
 
209 aa  167  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.244014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1674  Maf-like protein  47.85 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4776  Maf-like protein  46.38 
 
 
209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.714834  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21150  MAF protein  45.83 
 
 
235 aa  161  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  53.33 
 
 
475 aa  158  6e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0209  Maf-like protein  51.11 
 
 
208 aa  155  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  50.65 
 
 
484 aa  155  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08381  Maf-like protein  50 
 
 
186 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1328  Maf-like protein  46.41 
 
 
210 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1292  Maf-like protein  46.41 
 
 
210 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.981627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1309  Maf-like protein  46.41 
 
 
210 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1272  maf protein  43.78 
 
 
228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08240  MAF protein  49.32 
 
 
226 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1318  maf protein  48.36 
 
 
216 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13311  Maf-like protein  44.5 
 
 
222 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0768  maf protein  48.39 
 
 
184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1594  Maf-like protein  47.54 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.697875  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05680  MAF protein  48.11 
 
 
231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12351  Maf-like protein  37.38 
 
 
214 aa  138  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0455202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6393  Maf-like protein  50.25 
 
 
206 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13361  Maf-like protein  36.87 
 
 
203 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.377788  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13511  Maf-like protein  37.37 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467144  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1258  maf protein  37.37 
 
 
206 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.349097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  40.96 
 
 
199 aa  128  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0769  Maf-like protein  34.31 
 
 
211 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.91985  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13261  Maf-like protein  35.35 
 
 
204 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0698999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  44.16 
 
 
197 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  38.97 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14260  maf protein  34.39 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.62439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  40.21 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  31.58 
 
 
199 aa  118  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16091  Maf-like protein  32.68 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.257914  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1468  maf protein  44.83 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0649  maf protein  37.68 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733747  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0404  Maf protein  35.29 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  36.7 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  37.85 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1652  Maf-like protein  39.01 
 
 
197 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  32.98 
 
 
193 aa  115  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0535  maf protein  40.4 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.997587 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2269  Maf-like protein  36.73 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  33.33 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  40.51 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1513  maf protein  35.98 
 
 
192 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.914638  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2400  Maf-like protein  33.52 
 
 
192 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  38.67 
 
 
197 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  37.57 
 
 
197 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  40.74 
 
 
194 aa  108  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  37.29 
 
 
191 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  41.9 
 
 
194 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  32.29 
 
 
193 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  41.9 
 
 
194 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  38.8 
 
 
206 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  38.12 
 
 
197 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2112  Maf-like protein  33.52 
 
 
192 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  41.9 
 
 
194 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  34.92 
 
 
195 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  35.05 
 
 
191 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  33.51 
 
 
194 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  38.12 
 
 
197 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  35.05 
 
 
203 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  35.05 
 
 
191 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  35.05 
 
 
191 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  35.05 
 
 
191 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  35.05 
 
 
191 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  34.54 
 
 
191 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1933  maf protein  31.94 
 
 
197 aa  105  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.810739  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  38.04 
 
 
198 aa  104  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  34.87 
 
 
203 aa  104  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  34.39 
 
 
191 aa  104  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0513  maf protein  34.57 
 
 
192 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0115044  hitchhiker  0.0000000008482 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  36.73 
 
 
196 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0482  maf protein  38.95 
 
 
201 aa  104  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  38.89 
 
 
193 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  37.57 
 
 
197 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  37.57 
 
 
197 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>