More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1884 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 820 aa  663    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 868 aa  647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 813 aa  729    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 824 aa  769    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 868 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 858 aa  669    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 804 aa  690    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 887 aa  656    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1884  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 848 aa  1732    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.439942  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 806 aa  649    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 802 aa  689    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 863 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 863 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 814 aa  728    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 859 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 868 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 802 aa  689    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 802 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 802 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 805 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 823 aa  654    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 823 aa  654    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 868 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 865 aa  689    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 870 aa  662    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  62.88 
 
 		 830 aa  1053    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 862 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 864 aa  641    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2445  leucyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 857 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00377193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 878 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 872 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0710  leucyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 821 aa  646    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.699276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 819 aa  714    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 868 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 827 aa  734    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 851 aa  720    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 805 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 874 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 884 aa  680    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 875 aa  681    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 824 aa  767    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 829 aa  751    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 877 aa  638    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 802 aa  689    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 829 aa  742    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3198  leucyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 876 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 865 aa  716    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 866 aa  658    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 862 aa  663    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 829 aa  739    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 823 aa  772    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 858 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 824 aa  743    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 848 aa  655    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 862 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 819 aa  668    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0284  leucyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 882 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.453958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 817 aa  656    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 817 aa  672    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 815 aa  690    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 820 aa  662    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1121  leucyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 873 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 838 aa  662    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 813 aa  731    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 864 aa  664    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 906 aa  666    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 906 aa  670    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 856 aa  717    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 819 aa  681    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 874 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 824 aa  764    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 825 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 817 aa  723    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 870 aa  647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 871 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 816 aa  689    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 816 aa  707    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 802 aa  698    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 904 aa  696    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 859 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 859 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 864 aa  664    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 872 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 824 aa  787    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 865 aa  662    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 874 aa  639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 873 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 819 aa  748    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 804 aa  662    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 808 aa  657    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 863 aa  642    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  64.31 
 
 		 843 aa  1069    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3443  leucyl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 855 aa  973    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 829 aa  704    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 859 aa  674    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 859 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0771  leucyl-tRNA synthetase  65.57 
 
 		 832 aa  1101    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.18971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 904 aa  701    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 823 aa  748    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 828 aa  707    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>