28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1223 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1223  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  332  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1222  hypothetical protein  44.23 
 
 
160 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2830  hypothetical protein  35.76 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257591  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08430  Protein of unknown function (DUF2505)  30.63 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2610  hypothetical protein  35.93 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.122572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02610  Protein of unknown function (DUF2505)  26.32 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.344177  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6762  hypothetical protein  27.11 
 
 
165 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20520  Protein of unknown function (DUF2505)  29.94 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0605599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0822  hypothetical protein  31.25 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0652  hypothetical protein  30.43 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0665  hypothetical protein  30.43 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160914  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0645  hypothetical protein  30.43 
 
 
169 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4964  hypothetical protein  28.39 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3798  hypothetical protein  27.54 
 
 
165 aa  47.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3116  hypothetical protein  29.46 
 
 
171 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.02824  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0644  hypothetical protein  30.23 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0651  hypothetical protein  30.23 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08750  Protein of unknown function (DUF2505)  24.69 
 
 
164 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131074  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0664  hypothetical protein  30.23 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0157573  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1883  hypothetical protein  30.33 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.960325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1806  cyclase/dehydrase  23.88 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000623077  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1697  cyclase/dehydrase  31.58 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.128204  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0779  Protein of unknown function DUF2505  21.52 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0780  Protein of unknown function DUF2505  23.08 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576817  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3383  hypothetical protein  28.3 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3048  hypothetical protein  23.58 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.323444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1815  Protein of unknown function DUF2505  27.46 
 
 
394 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0091  hypothetical protein  25 
 
 
173 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>