16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0150 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0150  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  726    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0152  hypothetical protein  41.27 
 
 
404 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  39.73 
 
 
431 aa  209  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  40 
 
 
422 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1448  hypothetical protein  36.42 
 
 
372 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115033  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0633  hypothetical protein  34.01 
 
 
391 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1453  hypothetical protein  35.99 
 
 
352 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4418  hypothetical protein  35.89 
 
 
372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3184  hypothetical protein  32.92 
 
 
382 aa  139  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1455  hypothetical protein  31.05 
 
 
343 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3925  hypothetical protein  29.3 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2166  hypothetical protein  23.31 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  25.5 
 
 
333 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  51.11 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0510  hypothetical protein  22.89 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  23.75 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>