25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_A0029 on replicon NC_007483
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007483  Noc_A0029  helicase-like  100 
 
 		 693 aa  1431    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1466  hypothetical protein  65.94 
 
 		 683 aa  919    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0760  DEAD/DEAH box helicase-like  51.52 
 
 		 646 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3042  DEAD-like helicase  57.39 
 
 		 669 aa  797    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1963  Pseudomurein-binding repeat protein  44.15 
 
 		 683 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0186142  normal  0.027049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2529  hypothetical protein  46.14 
 
 		 684 aa  570  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0104824  hitchhiker  0.000333956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15590  hypothetical protein  46.14 
 
 		 705 aa  572  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000202658  unclonable  2.39416e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5332  Sea12  45.17 
 
 		 687 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4500  DEAD/DEAH box helicase-like  45.95 
 
 		 692 aa  559  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1751  YeeB-like protein  44.3 
 
 		 702 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3314  hypothetical protein  45.2 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1285  YeeB-like protein  44.79 
 
 		 703 aa  545  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0264  hypothetical protein  43.7 
 
 		 689 aa  527  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  57.1 
 
 		 597 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0291  excinuclease ABC, B subunit  33.6 
 
 		 884 aa  47  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0144  excinuclease ABC subunit B  42.31 
 
 		 730 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00842263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0839  excinuclease ABC subunit B  36.36 
 
 		 635 aa  45.4  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4510  excinuclease ABC subunit B  30.4 
 
 		 917 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2192  excinuclease ABC subunit B  42.31 
 
 		 725 aa  45.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4253  excinuclease ABC subunit B  28.99 
 
 		 761 aa  44.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.31724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12605  predicted protein  33.33 
 
 		 615 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5144  excinuclease ABC subunit B  40.38 
 
 		 934 aa  44.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0865  excinuclease ABC subunit B  37.5 
 
 		 668 aa  43.9  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1369  excinuclease ABC subunit B  36.92 
 
 		 662 aa  43.9  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0293  excinuclease ABC subunit B  22.65 
 
 		 676 aa  43.9  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0614567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>