15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5332 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0264  hypothetical protein  73.25 
 
 
689 aa  1026    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942958  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4500  DEAD/DEAH box helicase-like  83.84 
 
 
692 aa  1193    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15590  hypothetical protein  83.84 
 
 
705 aa  1215    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000202658  unclonable  2.39416e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2529  hypothetical protein  85.88 
 
 
684 aa  1229    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0104824  hitchhiker  0.000333956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1751  YeeB-like protein  69.76 
 
 
702 aa  981    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  88.41 
 
 
597 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5332  Sea12  100 
 
 
687 aa  1422    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1285  YeeB-like protein  70.1 
 
 
703 aa  975    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000202584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3314  hypothetical protein  69.83 
 
 
691 aa  987    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1963  Pseudomurein-binding repeat protein  74.26 
 
 
683 aa  1059    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0186142  normal  0.027049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3042  DEAD-like helicase  47.08 
 
 
669 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0760  DEAD/DEAH box helicase-like  45.79 
 
 
646 aa  571  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0029  helicase-like  45.17 
 
 
693 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1466  hypothetical protein  44.18 
 
 
683 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0135  excinuclease ABC subunit B  26.29 
 
 
666 aa  44.7  0.006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>