14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2529 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0264  hypothetical protein  72.05 
 
 
689 aa  1013    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942958  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4500  DEAD/DEAH box helicase-like  83.36 
 
 
692 aa  1195    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15590  hypothetical protein  92.95 
 
 
705 aa  1321    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000202658  unclonable  2.39416e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2529  hypothetical protein  100 
 
 
684 aa  1413    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0104824  hitchhiker  0.000333956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1751  YeeB-like protein  68.71 
 
 
702 aa  981    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  86.67 
 
 
597 aa  700    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5332  Sea12  85.88 
 
 
687 aa  1229    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1285  YeeB-like protein  69.26 
 
 
703 aa  968    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000202584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3314  hypothetical protein  69 
 
 
691 aa  980    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1963  Pseudomurein-binding repeat protein  73.42 
 
 
683 aa  1052    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0186142  normal  0.027049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3042  DEAD-like helicase  46.2 
 
 
669 aa  588  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0760  DEAD/DEAH box helicase-like  46.15 
 
 
646 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0029  helicase-like  46.14 
 
 
693 aa  567  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1466  hypothetical protein  44.87 
 
 
683 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>