15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1152 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1152  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  175  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.314563 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1362  hypothetical protein  65.52 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  49.4 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0876  hypothetical protein  32.53 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.195647 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  39.66 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  24.39 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  24.1 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  25 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  31.65 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  21.59 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  28.05 
 
 		 116 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  22.37 
 
 		 117 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  22.37 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  25 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  29.63 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>