30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0725 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  25.85 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  24.15 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  28.57 
 
 
250 aa  72  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  28.12 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  24.89 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  27.23 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  28 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  26.34 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  28 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  26.13 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  24.89 
 
 
261 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  23.89 
 
 
256 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  23.89 
 
 
250 aa  55.5  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  24 
 
 
302 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  25.33 
 
 
302 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  24.11 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  28 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  23.74 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  24.78 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  24 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  21.72 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  27.66 
 
 
251 aa  48.9  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  25.22 
 
 
256 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  25 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  25.53 
 
 
252 aa  45.1  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  28.08 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  22.17 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  22.91 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>