13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4186 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4186  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
545 aa  1105    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2890  beta-lactamase domain protein  35.35 
 
 
551 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31669  normal  0.842026 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3400  exonuclease of the beta-lactamase fold class-like protein  38.27 
 
 
791 aa  298  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2687  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 
591 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  24.88 
 
 
813 aa  48.9  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4103  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
539 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.12 
 
 
410 aa  47.4  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10962  interstrand crosslink repair protein (Eurofung)  30.66 
 
 
832 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  30.82 
 
 
473 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3813  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
571 aa  45.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  25.95 
 
 
485 aa  44.3  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47094  predicted protein  30.46 
 
 
503 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.95 
 
 
532 aa  43.5  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>