18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3184 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3184    100 
 
 
681 bp  1350    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.981757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3181    98.83 
 
 
681 bp  1287    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4959  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.75 
 
 
600 bp  323  3.9999999999999996e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  80.35 
 
 
678 bp  226  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  80.24 
 
 
678 bp  224  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  80.04 
 
 
678 bp  212  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  79.9 
 
 
678 bp  208  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3224  transposase  81.14 
 
 
681 bp  188  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4676    82.64 
 
 
674 bp  180  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4512    82.53 
 
 
518 bp  137  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4898    79.74 
 
 
678 bp  131  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.198767  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4889    83.04 
 
 
728 bp  127  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.163217  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4126    86.36 
 
 
680 bp  79.8  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2685    87.84 
 
 
642 bp  75.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00531158  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4506    88.52 
 
 
454 bp  65.9  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0138    85.71 
 
 
235 bp  65.9  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4099    82.8 
 
 
663 bp  58  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0858  transposase  90.91 
 
 
681 bp  56  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>