191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3224 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3224  transposase  100 
 
 
226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  75.68 
 
 
225 aa  356  9.999999999999999e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  75.23 
 
 
225 aa  354  5.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  74.32 
 
 
225 aa  353  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  72.97 
 
 
225 aa  343  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0858  transposase  55.75 
 
 
226 aa  254  8e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4959  Transposase and inactivated derivatives-like protein  63.24 
 
 
199 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0068  transposase  39.29 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0984567 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0059  IS240-type transposase (ISH102)  36.46 
 
 
206 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254142  normal  0.2099 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4218  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.1 
 
 
205 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2554  transposase  51.65 
 
 
97 aa  99.4  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191723 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3528  transposase  33.81 
 
 
212 aa  94.7  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1512  transposase  33.81 
 
 
212 aa  94.7  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0582203 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1494  transposase  33.81 
 
 
212 aa  94.7  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.913135  normal  0.873536 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0923  transposase  33.72 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.134513  decreased coverage  0.0000447966 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  25.98 
 
 
319 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  29.59 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  29.59 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  29.59 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  29.59 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4769  hypothetical protein  69.05 
 
 
51 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0539  transposase  26.32 
 
 
478 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000512999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0694  transposase  26.32 
 
 
478 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000208331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  26.32 
 
 
470 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  28.99 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2050  transposase  26.32 
 
 
478 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963714  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  28.99 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  28.99 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  28.99 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  34.58 
 
 
164 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1903  transposase  47.37 
 
 
63 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  26.7 
 
 
340 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  26.37 
 
 
343 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  26.74 
 
 
340 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  26.74 
 
 
340 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  27.27 
 
 
340 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  27.27 
 
 
340 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  28.4 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  28.4 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  28.47 
 
 
347 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  27.27 
 
 
340 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  28.4 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  31.72 
 
 
234 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  31.72 
 
 
234 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  31.72 
 
 
234 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  31.72 
 
 
234 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  33.96 
 
 
240 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  33.96 
 
 
240 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  33.96 
 
 
240 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  33.96 
 
 
240 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  33.96 
 
 
240 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  31.72 
 
 
234 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  33.96 
 
 
240 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  27.27 
 
 
340 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  33.96 
 
 
240 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  33.96 
 
 
240 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  33.96 
 
 
240 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  31.72 
 
 
234 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  31.72 
 
 
234 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  31.72 
 
 
234 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  31.72 
 
 
234 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  31.72 
 
 
234 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  31.72 
 
 
234 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  33.96 
 
 
240 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  33.96 
 
 
240 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  33.96 
 
 
240 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  33.96 
 
 
240 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  33.02 
 
 
226 aa  51.6  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  31.72 
 
 
234 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  26.63 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  27.78 
 
 
347 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  24.6 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  24.6 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  24.6 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  24.6 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  26.2 
 
 
340 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  33.33 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  33 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0695  transposase  29.73 
 
 
117 aa  49.7  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117389  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  35.71 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  34.48 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  27.85 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  28.57 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  27.85 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  27.85 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  30 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3491  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  32.61 
 
 
213 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  31.58 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  36.25 
 
 
218 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  27.22 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  25.32 
 
 
293 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  33.7 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  33.7 
 
 
237 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  27.04 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  31.58 
 
 
302 aa  46.6  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  29.17 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  27.22 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  29.17 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  27.22 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>