106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4959 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4959  Transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 
199 aa  409  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  68.66 
 
 
225 aa  197  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  67.91 
 
 
225 aa  196  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  66.91 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  67.91 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3224  transposase  63.24 
 
 
226 aa  174  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0858  transposase  50.75 
 
 
226 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2554  transposase  52.17 
 
 
97 aa  101  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191723 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0923  transposase  37.21 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.134513  decreased coverage  0.0000447966 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0059  IS240-type transposase (ISH102)  35.25 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254142  normal  0.2099 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0068  transposase  36.07 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0984567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1494  transposase  36.36 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.913135  normal  0.873536 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1512  transposase  36.36 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0582203 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3528  transposase  36.36 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4218  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.5 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1903  transposase  48.33 
 
 
63 aa  58.5  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  29.81 
 
 
240 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  29.81 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  29.81 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  29.81 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  29.81 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  29.81 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  29.81 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  29.81 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  29.81 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  29.81 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  29.81 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  29.81 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  29.81 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  29.81 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  29.81 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  29.81 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  29.81 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  29.81 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  29.81 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  29.81 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  29.81 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  29.81 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  29.81 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  29.81 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  29.81 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  32.63 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  32.63 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  32.63 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  32.63 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  32.63 
 
 
226 aa  49.3  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  34.74 
 
 
224 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  32.63 
 
 
226 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  32.63 
 
 
226 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  32.63 
 
 
226 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  34.74 
 
 
224 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  34.74 
 
 
224 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  31.67 
 
 
238 aa  48.9  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  34.74 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  34.74 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0020  IS431mec-like transposase  34.74 
 
 
224 aa  48.5  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  34.74 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  34.74 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  34.74 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  34.74 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  33.68 
 
 
214 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  31.96 
 
 
164 aa  48.5  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  33.68 
 
 
208 aa  48.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  30.7 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  33.91 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  33.68 
 
 
221 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  33.68 
 
 
224 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  33.68 
 
 
221 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  33.68 
 
 
224 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  29.52 
 
 
228 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  31.58 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  31.58 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  30.53 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  31.58 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  36.96 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  31.58 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  32.17 
 
 
236 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  32.17 
 
 
237 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  32.53 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  30.19 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  31.58 
 
 
224 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  28.93 
 
 
212 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  35.14 
 
 
236 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  33.04 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  30.85 
 
 
236 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  31.58 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  31.58 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0695  transposase  33.7 
 
 
117 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117389  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  34.69 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  34.69 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1778  transposase  32.41 
 
 
250 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.887632  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  32.61 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  31.58 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  32.17 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  32.17 
 
 
237 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  33.78 
 
 
262 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4769  hypothetical protein  65.62 
 
 
51 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  29.75 
 
 
224 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1015  transposase  30.63 
 
 
134 aa  42.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653024  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  31.94 
 
 
235 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>