23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1165 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1165  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.103662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  59.45 
 
 
218 aa  248  7e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1789  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.12 
 
 
222 aa  169  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160371  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3026  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.72 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0887478  normal  0.0112565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2431  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.06 
 
 
224 aa  151  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.85 
 
 
227 aa  150  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0815  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.72 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.49888 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1973  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.67 
 
 
224 aa  139  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0839  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.68 
 
 
216 aa  127  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2802  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.82 
 
 
227 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.978362  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.18 
 
 
224 aa  111  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1998  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.8 
 
 
222 aa  111  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2371  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.82 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1989  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.8 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.89 
 
 
209 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  25.78 
 
 
272 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  25.69 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  25.23 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2811  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.69 
 
 
233 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1501  hydrolase  31.53 
 
 
223 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.401129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  33.63 
 
 
193 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.55 
 
 
212 aa  42  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  33.01 
 
 
229 aa  42  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>