17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4653 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  70.39 
 
 		 325 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  67.39 
 
 		 319 aa  427  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  68.71 
 
 		 311 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  62.42 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  61.8 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  61.49 
 
 		 320 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  59.01 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  61.9 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  59.86 
 
 		 344 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  50.33 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  40.91 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.24 
 
 		 828 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  23.49 
 
 		 517 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  22.08 
 
 		 517 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  23.95 
 
 		 918 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  24.84 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>