15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4500 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0264  hypothetical protein  72.36 
 
 		 689 aa  1014    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942958  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4500  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 692 aa  1423    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15590  hypothetical protein  82.65 
 
 		 705 aa  1181    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000202658  unclonable  2.39416e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2529  hypothetical protein  83.36 
 
 		 684 aa  1200    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0104824  hitchhiker  0.000333956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1751  YeeB-like protein  66.62 
 
 		 702 aa  955    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  84.27 
 
 		 597 aa  675    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5332  Sea12  84.13 
 
 		 687 aa  1203    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1285  YeeB-like protein  68.03 
 
 		 703 aa  955    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3314  hypothetical protein  71.3 
 
 		 691 aa  1005    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1963  Pseudomurein-binding repeat protein  74.09 
 
 		 683 aa  1068    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0186142  normal  0.027049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3042  DEAD-like helicase  47.38 
 
 		 669 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0760  DEAD/DEAH box helicase-like  46.47 
 
 		 646 aa  593  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1466  hypothetical protein  45.67 
 
 		 683 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0029  helicase-like  45.95 
 
 		 693 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  23.27 
 
 		 550 aa  45.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>